EDAD GEOLOGICA
El municipio de Guazapa se origino en la edad cenozoica, periodo neógeno; en las postrimerías de la época pleocenica osea hace unos dos millones de años.
Es posible que su aparecimiento se halle debido a un movimiento apirogenico de mayores proporciones, pero después, el territorio se modifico al formarse dos fallas geológicas hacia la parte media del extremo sur y luego por una extensa actividad volcánica cimentadora del suelo local.
Posesión Indígena: los elementos arqueológicos encontrados en este municipio son pruebas más que suficientes para demostrar que este lugar era subsidiaria de un centro ceremonial y administrativo maya cuyo vestigio estructural se encuentra en las ruinas arqueológicas de Cihuatán, en el Cantón Piñalitos (Municipio de Aguilares), con 3,500 años a.c., la posesión del territorio paso a manos de núcleos Chortis de un señorío establecido en la cima del cerro inciensal (municipio de Cítala, departamento de Chalatenango). Estos fueron desalojados hacia el año 360 d.c, por guerreros nahuas chichimecas o pipiles fundadores del señorío de Cuscatlán.
ÉPOCA COLONIAL
En 1740, según el alcalde mayor de San Salvador don Manuel de Gálvez Corral, San Miguel Guazapa tenía 12 indios tributarios o jefes de familia (unos 60 habitantes).
Monseñor Pedro Cortez y Larraz dice que en 1770 pertenecía a la Parroquia de San Salvador y que su población estaba representada por 11 familias de indios con 70 personas.
Don Antonio Gutierrez y Ulloa, Corregidor intendente de San Salvador, dice que en 1807 Guazapa era una “Reducción con 454 habitantes, todos ladinos a excepción de unos 30 o 40 indios. Su terreno regular algo pantanoso; se cultivan frutos y semillas y se labora añil.
POSESION ESPAÑOLA
En el año de 1543 y por ordenanza de la Real Audiencia de los confines, fue creado el cabildo de San Miguel Guazapa el cual, en 1738 extendió su territorio al aumentársele el extinguido cabildo de San José el Paxnal.
En 1786 San Miguel de Guazapa ingreso al partido electoral de San Salvador y en esta fecha le fueron separados los territorios antes mencionados, para volver a establecer el cabildo de San José el Paxnal.
Sucesos posteriores: Como municipios del distrito de San Salvador perteneció del (12 de junio) 1824 al (22 de mayo) 1835 al departamento de San Salvador y el 22 de mayo de 1835 fue incorporado como municipio del distrito de Suchitoto, en el departamento de Cuscatlán.
El 18 de febrero de 1841 el pueblo de Guazapa quedó incorporado como cantón del distrito electoral de Quezaltepeque. Datos estadísticos proporcionados en 1859 por la municipalidad de Guazapa, consta que este pueblo tenía 1,422 habitantes alojados en 16 casas de teja y 98 pajizas; una municipalidad compuesta por un alcalde, cuatro regidores y un síndico; una iglesia filial o anexa a la parroquia de Apopa.
En 1890 aparece ya como pueblo del distrito de Apopa, ignorándose en virtud de que Ley se segrego del de Suchitoto, con 1610 habitantes, aunque el 17 de marzo de 1892 se extinguió el distrito de Apopa y se creó el de Tonacatepeque, en cuya área Jurisdiccional quedó incluido el pueblo de Guazapa.
Por Ley el 20 de abril de 1912 se segrego de la jurisdicción de Suchitoto, departamento de Cuscatlan, y se anexó a la jurisdicción de Guazapa, departamento de San Salvador, la finca denominada “San Cristóbal”, propiedad de don Antonio Peña Martel.
Título de Villa y Ciudad
En 1890 el geógrafo don Gullermo Dawson cita esta población con el título de pueblo, pero en la estadística de don Julian Escoto correspondiente a 1892 se le menciona ya con el título de villa, mas no se ha podido localizar el documento justificativo de tal promoción.
Durante la administración de don Carlos Meléndez y por Decreto Legislativo de 15 de julio de 1918 se confirió el título de ciudad a la Villa de Guazapa, “por su incremento de población como por sus progresos materiales y morales”.